Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms