Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms