Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms