Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms