Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX5P78411 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX5P78411 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX5P78411 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms