Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms