Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRP55822 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms