Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms