Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLP1P51693 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLP1P51693 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLP1P51693 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLP1P51693 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLP1P51693 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLP1P51693 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLP1P51693 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLP1P51693 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLP1P51693 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APLP1P51693 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLP1P51693 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLP1P51693 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms