Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2AP48426 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms