Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5OP48047 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5OP48047 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms