Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL4AP40617 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL4AP40617 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms