Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA7P31268 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms