Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB3BP20337 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB3BP20337 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms