Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD33P20138 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD33P20138 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD33P20138 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms