Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHGAP10645 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHGAP10645 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHGAP10645 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHGAP10645 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHGAP10645 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHGAP10645 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHGAP10645 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms