Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225BP0DP42 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms