Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms