Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLSTN1O94985 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms