Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms