Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN3BO60391 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms