Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB3O43889 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms