Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRC1O43663 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRC1O43663 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms