Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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