Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD5O14737 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms