Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APAF1O14727 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APAF1O14727 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APAF1O14727 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APAF1O14727 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms