Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms