Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCRIP1C9JLW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms