Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms