Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM247A6NEH6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms