Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms