Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms