Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNND2Q9UQB3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms