Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms