Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLEC4AQ9UMR7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLEC4AQ9UMR7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLEC4AQ9UMR7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms