Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZMYND8Q9ULU4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZMYND8Q9ULU4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms