Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRDM4Q9UKN5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms