Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms