Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN3Q9UKA8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCAN3Q9UKA8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms