Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP21Q9UK80 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms