Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms