Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms