Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms