Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms