Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms