Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BIN3Q9NQY0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms