Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC52A2Q9HAB3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms