Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SHANK2-AS3Q9BTD1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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