Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms