Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIN2AQ99865 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms